S-Pen 一直以來都是 Galaxy Note 系列的靈魂，來到 Note 7 當然加入更多新功能，其中 S-Pen 終於都防水防塵，咁大家用的時候就無需再擔心會怕整濕整污糟。
另外，S-Pen 的筆觸亦都大幅縮細，由以往的 1.6mm 大幅縮減至 0.7mm，好處就是更適合用作更精準的繪圖或需要更精細的書寫。筆壓方面比起上代更有大幅提升，由上代的 2048 提升一倍至 4096，要繪畫不同粗幻的線條就更加容易。
S-Pen 在功能上亦都有新玩法，首先只要將 S-Pen 放在不明白的文字之上，再按一下即可進行翻譯，無需再用複雜的翻譯軟件。
除此之外，更可以直接放大熒幕上的任何畫面，又或者擷取短片成為 GIF 方便即時分享。
最後，就算在熒幕關閉的情況下，只要拉出 S-Pen 就可以啟用 Off-Screen Memo 功能，可以直接在熒幕關閉的情況下書寫，並把訊息顯示在鎖屏畫面之上。
