Samsung GS4 因內置不少軟件新功能，令 16GB ROM 版本只有約 8GB 可用空間，近日香港 Samsung 針對此問題為 3G 和 4G 版 GS4 提供系統更新，用家可透過 Kies 或 FOTA 進行更新，更新前建議先將手機資料備份，另外建議用 Wi-Fi 進行更新以免產生額外流動數據費用。
3G 版更新事項包括，改善相機的啟動速度、新增 App2SD 功能、新增相機自動夜景偵測功能、優化記憶體、在簡易模式的電話鍵盤中新增筆劃搜尋功能、改善三星瀏覽器兼容性、更新 WiFi 韌體、於通知面板上添加智能暫停快速設定鍵。
4G 版更新事項包括，新增應用程式移動到 SD 卡功能、相機設定自動夜景偵測預設為開啟、新增駕駛模式設定目錄、於通知面板上添加智能暫停快速設定鍵、修復在插入特定耳機後播放音樂時所產生的破音問題、修復無法連接特定 WiFi router 問題。